美研究人员设计出改良柑橘类水果品种的基因芯片

美研究人员设计出改良柑橘类水果品种的基因芯片

  据Eurekalert网站2006年3月2日报道，美国加州大学河畔分校的研究人员与Affymetrix公司合作开发出一种柑橘类基因组芯片，它将能帮助改良柑橘类植物的品种，并带来更好地管理柑橘类植物的方法。

  通过确定与口味、酸度和病害等有关的基因在柑橘类植物组织中的表达，该芯片可以向研究人员提供一些有用的信息，从而矫正目前存在的问题并对水果进行改良。这种柑橘类基因组芯片将被用于研发新的诊断工具，改良柑橘类产业和收获后的水果处理，并将有助于理解柑橘类植物疾病的根本机制。研究人员还将研究与柑橘类产品有关的一些特征，如便于剥皮、无籽、美味成分、害虫和疾病控制、营养特征和繁殖生长。

  据加州大学河畔分校生物学和植物科学系的遗传学教授、研究项目负责人迈克-卢斯称，这些柑橘类基因组芯片将帮助他们快速检查柑橘类植物的特征，如果一个特征给消费者带来问题，例如不喜欢的口味，他们可以确认与这种特征相关的基因，并通过对基因的处理来改善口味。他还称，这种芯片还可帮助他们解决柑橘类植物的病害问题，当一棵柑橘树受到一种病毒的攻击，芯片可以帮他们发现柑橘树的细胞中发生了什么变化。另外，使用这种芯片还能使研究人员更好的了解当柑橘类水果成熟并被冷藏时，细胞水平的变化，这最终将帮助研究人员找到更好办法来储藏这些已改良口味的水果。

  柑橘类基因组芯片是由Affymetrix公司制造的，它由一个玻璃晶片制成。在它上面，有近100万种不同的柑橘类DNA片段被存放在一个栅格或微阵列中，生产方法类似于电脑芯片。这种玻璃晶片被装在一个比一张信用卡小一点的塑料容器中。

  当使用芯片时，研究人员要纯化来自植物组织的总RNA（它反映在组织中表达的基因），再将RNA进行化学标记，接着用RNA样本“清洗”芯片。如果一种基因在组织中表达，它的相应RNA将与芯片中的相应DNA序列结合。由于被标记，结合的RNA将有一种明显的记号，就像一个计算机屏幕上的明亮和模糊像素。对芯片中发出信号的这段DNA的分析就显示出哪种基因正在组织中表达。

  这种芯片是第一个商业化的柑橘类基因组，它对2万多种不同基因的表达进行分析。这种基因组还将被用于研究柑橘的详细基因图谱，它将帮助研究人员定位许多基因，而这些定位信息将使帮助开发优良的新品种。加州大学河畔分校的另一名教授蒂莫西-克劳斯称，采用公开的柑橘类基因序列来开发一种全新的工具不仅将有利于所有柑橘类植物研究人员，而且有助于推动当地和全世界的柑橘类水果产业的发展。

英文原文链接参见_releases/2006-03/uoc--urd030106.php

[作者:雅龙]

[来源中国科学技术信息研究所加工整理]

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